El viejo Cusco se despobla
Desde los primeros años de su gobierno, Pachacutec se dedicó a la reconstrucción del Cusco. El cronista Sarmiento de Gamboa relata que el Inca tenía el hábito de caminar por la ciudad observando cuidadosamente todo.
Como la mejor manera de lograr su propósito, decidió desalojar a los habitantes de Cusco para volver sobre el pueblo y redistribuir las tierras y propiedades a aquellos que él creía que tenían derecho a vivir en su capital.
Con su vara de medir en la mano, el Inca midió personalmente las calles y áreas públicas, para gran satisfacción de los panacas, la gente de linaje real y los antiguos ayllus que eran los custodios del soberano.
Hasta ese momento, Cusco sólo había sido un asentamiento algo rústico, sujeto a frecuentes inundaciones de sus dos pequeños ríos, el Hautanay y el Tulumayo.
La reconstrucción se inició con la canalización de los dos cursos de agua para evitar el empantanamiento en la época de lluvias y para construir los acueductos de la ciudad. Betanzos nos cuenta el método utilizado para la reconstrucción del Cusco. Pachacutec, utilizando sus acuerdos de reciprocidad, convocó a una reunión de las principales curacas y autoridades andinas en la capital. Después de las festividades habituales, se acordó enviar a diez enviados a las ciudades vecinas para recoger provisiones y encontrar canteras adecuadas.
Una vez resueltos todos sus problemas, los enviados enviaron obreros a Cusco. Algunos tenían la tarea de acarrear rocas ásperas para los cimientos, otros traían arcilla pegajosa y paja para fabricar ladrillos de adobe, y otros recogían madera de aliso. El arquitecto Gasparini cree que los expertos canteros, herederos del arte de las antiguas Tiahuanacotas, fueron traídos de Collao.
Las plazas incas eran extraordinariamente grandes, en forma de trapecio, y estaban destinadas a actividades religiosas y sociales. El rito de reciprocidad tuvo lugar en la plaza de Aucaypata, donde los ayllus y los clanes reales se reunían para comer, beber y bailar las danzas ceremoniales del calendario Inca.
Esta plaza también fue utilizada para las celebraciones triunfales de las victorias del ejército Inca. Estos consistían en colocar en el suelo todo el botín y los prisioneros tomados en cada incursión. El Inca procedió a caminar sobre estas personas y objetos, para simbolizar la sumisión de sus enemigos y su recién adquirido poder sobre sus territorios.
El Coricancha
Pachacutec puso todos sus esfuerzos en la reconstrucción del santuario del Inti Cancha o del Recinto del Sol, que hasta entonces había sido bastante modesto. No sólo las paredes estaban adornadas con tallas detalladas, sino que los adornos rellenos de oro añadían un toque esplendoroso. Los primeros españoles en ver este santuario lo reportaron como un jardín lleno de plantas, flores, pájaros e insectos hechos de oro macizo.
Los templos principales del santuario estaban dedicados respectivamente al Sol, la Luna, el Trueno y el Arco Iris. Todos ellos estaban comunicados con el «jardín dorado». Diferentes relatos dicen que el sol estaba representado en una de las paredes por una lámina ovalada de oro, mientras que Garcilaso menciona el símbolo del sol como una cara.
Las momias de los antiguos soberanos se guardaban en el templo y se llevaban a la plaza para las ceremonias mayores. El templo lunar contenía los restos de los collas o reinas, haciendo guardia a los lados de la callanca. Sólo la madre de Huayna Capac, Mama Ocllo, se enfrentó a la figura lunar.
Cambios religiosos
La mayoría de los cronistas mencionan los cambios religiosos que siguieron a la guerra contra los chancas. Aparentemente, los principales sacerdotes estaban a favor de la huida del Inca Viracocha, y estaban dispuestos a someterse a sus enemigos con esta condición.
Después de la victoria de Cusi Yupanqui (el futuro Pachacutec), la situación de los sacerdotes se volvió incómoda. Además, el joven príncipe necesitaba un padre que lo nombrara como el nuevo soberano. Cuando Viracocha se negó a «poner pie» en los cautivos y el botín, Cusi Yupanqui fue al templo de Inti Cancha y le pidió directamente al Sol autoridad. A partir de ese momento, el Inca fue considerado el vástago del Sol.
Esto implicó un cambio religioso con respecto al culto anterior al dios Viracocha, que sólo tenía un templo en su honor dentro de la nación Inca, mientras que ahora la influencia del Sol se había incrementado.
Naturalmente, estos eventos no influyeron en la veneración por las numerosas huacas, apus y otros ídolos existentes. Además, Pachacutec vio la oportunidad de mantener las principales huacas en Cusco, otorgándoles sirvientes, tierras y otras propiedades. Esta era una forma de controlar posibles levantamientos, ya que los miembros de la tribu temían posibles represalias contra sus ídolos en caso de motín.